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Trends in Cell Biology特刊 | 核糖体动态与细胞稳态
2025-07-27 14:23  浏览:78

生命科学

Life science

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本期Trends in Cell Biology特刊深入探讨了核糖体功能、翻译机制和细胞健康之间错综复杂的关系。这些论文全面概述了核糖体和翻译在各种生物过程中发挥的关键作用,及其对健康和疾病的影响。

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Trends in Cell Biology创刊35周年特刊:核糖体动态与细胞稳态

Trends in Cell Biology创刊35周年之际,我们驻足回望这本期刊自诞生以来走过的非凡历程。三十五载春秋里,Trends in Cell Biology像一部编年史般,记录了细胞研究领域的嬗变轨迹,为那些重塑了我们对基础生物过程理解的先锋思想提供了交流平台。从对细胞结构的早期探索,到如今复杂的分子与系统分析,Trends in Cell Biology始终拥抱科学创新,培育了充满活力的研究者群体。

核糖毒性应激反应对细胞周期的调节

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细胞必须感知并应对无数的刺激,才能维持其功能。应激活化蛋白激酶(stress-activated protein kinases, SAPK)是对这些刺激做出反应的综合网络的一部分,在决定细胞行为方面起着关键作用。过去五年,学界意外发现,核糖体和核糖毒性应激反应(ribotoxic stress response, RSR)是SAPK网络的关键调节因子,也是全局细胞命运变化的驱动因素。特别值得一提的是,RSR-SAPK 信号传导对细胞增殖有重大影响,这对衰老和癌症具有重要意义。来自约翰·霍普金斯大学医学院的Sergi Regot团队发表Review综述,探讨了SAPK p38对细胞周期的调控,尤其关注核糖毒性应激对关键细胞周期转换的影响。

内质网-线粒体接触点:内质网应激条件下线粒体mRNA的避难所

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紧密的线粒体与内质网接触(mitochondria-endoplasmic reticulum contacts, MERCS)在细胞稳态中发挥着至关重要的作用。来自智利大学(Universidad de Chile )和美国巴克衰老研究所(Buck Institute for Research on Aging)的Claudio Hetz团队发表Spotlight短评,回顾了Brar 等人揭示的一种新机制:内质网应激期间,线粒体mRNA可在新的情境特异性MERCS上摆脱全局翻译抑制,表明空间调控翻译是应对细胞应激的一种关键适应性策略。

内质网蛋白质降解途径:内质网相关降解和内质网自噬

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蛋白质在内质网中的错误折叠和聚集与多种人类疾病存在因果关系。内质网相关降解(ER-associated degradation, ERAD)和内质网自噬(ER-phagy)是消除内质网错误折叠蛋白质和聚集体的两条关键途径。虽然这两条途径都具有良好的生物化学特征,但我们对其生理相关性和意义的了解依然有限。近年来,学界取得了重大进展,生成并定义了各种基因敲除和基因敲入小鼠模型,确定了人类疾病相关变异或致病变异,并深入了解了ERAD和自噬在生理环境中的协调作用。来自美国弗吉尼亚大学医学院(University of Virginia, School of Medicine)的Shuangcheng Alivia Wu、Zexin Jason Li和Ling Qi发表Feature Review专题综述,回顾了这些进展,强调了ERAD和内质网自噬途径中高度保守的SEL1L-HRD1(suppressor of lin-12-like-hydroxymethyl glutaryl-coenzyme A reductase degradation 1)蛋白复合物在健康和疾病中的关键作用。

死于核糖体

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除了作为蛋白质生产工厂这一重要作用外,核糖体还是细胞应激的分子传感器。核糖体停滞和碰撞会触发特定的应激信号,包括核糖毒性应激反应(ribotoxic stress response, RSR)。在存在大量翻译畸变时,MAP3K激酶ZAKα会启动RSR,进而激活MAPK应激响应激酶p38和JNK。新近研究揭示了RSR通路的重要作用:在广泛的生理相关条件下,触发包括细胞凋亡和焦亡在内的程序性细胞死亡。来自丹麦哥本哈根大学的Simon Bekker-Jensen团队发表Review综述,就程序性核糖体毒性和意外核糖体毒性、RSR信号转导和细胞死亡之间的已知联系,回顾了最新研究成果。

代谢与mRNA 翻译:癌症可塑性的纽带

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在恶劣的肿瘤微环境中,由于突变、缺氧和营养缺乏,以及抗癌治疗的影响,肿瘤经常面临能量剥夺。这种代谢应激会引发mRNA翻译的适应性重编程,进而调整代谢可塑性和相关信号通路,以确保肿瘤细胞的存活。新的研究证据开始揭示代谢与mRNA翻译之间复杂的相互作用,阐明了代谢应激下的核糖体组装同步机制和翻译编程重构机制。来自四川大学的沈慎思(Shensi Shen)和来自法国蔚蓝海岸大学(Université Côte d’Azur)的Michael Cerezo团队发表Review综述,回顾了有关代谢与mRNA 翻译之间协调关系的最新研究进展,为靶向癌症代谢和翻译从而破坏癌细胞可塑性和生存,提供了洞见。

核糖体组装功能失调与MDM4外显子跳跃

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新近研究揭示,核仁应激(nucleolar stress)会增强MDM4外显子跳跃,并通过核糖体蛋白L22(RPL22;eL22)激活p53。肿瘤相关L22突变会导致全长MDM4的合成,从而克服p53对肿瘤的抑制作用。来自德国哥廷根大学医学中心(University Medical Center Göttingen)的Jennifer Jansen和Matthias Dobbelstein发表Forum短评,探讨了MDM4剪接模式如何整合应激信号,以完成p53依赖性细胞命运决定。

内质网蛋白稳态网络在健康衰老中的核心作用

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衰老的轨迹因人而异,其特点是功能逐渐衰退,往往导致疾病状态。衰老的核心特征之一是蛋白稳态恶化,内质网功能受到严重影响。内质网压力的监测和调节由未折叠蛋白反应(unfolded protein response, UPR)完成,UPR是一种信号通路,可介导恢复蛋白稳态的适应过程。针对多种模式生物(酵母、蠕虫、苍蝇和小鼠)以及人体组织的研究表明,适应性UPR信号转导有助于健康衰老(healthy aging)。利用小分子和基因疗法改善内质网蛋白稳态的策略可减少哺乳动物正常衰老过程中器官功能的衰退。来自智利大学的Claudio Hetz和来自加州大学伯克利分校的Andrew Dillin发表Feature Review专题综述,就内质网蛋白稳态网络对正常衰老的意义及其与细胞衰老等其他衰老标志之间的关系,回顾了最新研究。

动态rRNA修饰:核糖体异质性的来源

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核糖体 RNA(rRNA)是几乎所有细胞类型中最丰富的RNA分子。该研究领域的普遍共识是,rRNA修饰在很大程度上是物种特异性的,既往大多数研究和数据库仅根据物种起源对修饰进行分层,而不考虑其他层次的复杂性。但新证据表明,动态rRNA修饰可能具备更多层次的复杂性并在发育和疾病中发挥重要作用。来自西班牙庞培法布拉大学(Universitat Pompeu Fabra )的Eva Maria Novoa团队发表Review综述,总结了有关不同生物环境中rRNA修饰异质性和动态性的最新证据,对“一个物种一种rRNA修饰模式”的简单化观点提出了质疑。rRNA家族在组织、发育阶段和疾病中广泛存在,但在很大程度上仍有待探索,研究人员重点介绍了迄今为止的rRNA修饰动态相关研究,以及长读程测序方法对rRNA 研究的重大促进作用。

非编码翻译的抑制机制

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人类基因组中的大部分DNA序列都是非编码序列,不用于合成蛋白质。但核糖体足迹的全基因组图谱显示,已注释的非编码序列中存在广泛的翻译现象,包括长非编码RNA、非翻译区(untranslated regions)和mRNA内含子。目前为止,我们对于细胞如何抑制来自各种非编码序列的潜在毒性蛋白翻译,所知甚少。来自哥伦比亚大学欧文医学中心(Columbia University Irving Medical Center)的Xuebing Wu团队发表Review综述,总结了非编码翻译的缓解机制,包括BAG6介导的蛋白酶体降解途径,研究显示该途径可能是后生动物细胞(metazoan cells)抑制各种非编码序列翻译的统一机制。

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